Жанат Айтпаева имеет высшее педагогическое и экономическое образование. Она кандидат педагогических наук и магистр экономики и бизнеса. Общий стаж работы в образовании и госуправлении превышает 35 лет.
Трудовую деятельность Айтпаева начинала учителем. Позже она руководила Восточно-Казахстанским региональным научно-практическим центром «Дарын», отделом образования Усть-Каменогорска, работала проректором Astana IT University, директором КГУ «Алматы дарыны» и заместителем руководителя управления образования Алматы.
С сентября 2025 года она занимала должность главного инспектора отдела идеологической работы аппарата акима Алматы и секретаря комиссии по делам несовершеннолетних и защите их прав.
Айтпаева — автор и соавтор учебников, пособий и научных монографий по вопросам управления образованием и педагогического лидерства. Её наградили нагрудным знаком «Почётный работник образования Республики Казахстан», медалью «25 лет Независимости Республики Казахстан», а также ведомственными наградами и почётными грамотами.
Ранее руководителя аналогичного управления представили в Павлодарской области.